naica® Damlacık Çip Dijital PCR Sistemi, Kore Sığır Etindeki Moleküler Belirteçleri Doğru Bir Şekilde Değerlendirerek Genetik Kaynakların Tanımlanmasına Yardımcı Oluyor

Bos taurus coreanae, Kore tüketici pazarında gıda kaynağı olarak kullanılan evcilleştirilmiş bir memelidir. Sığır eti tüketimi diğer ırklara göre çok daha fazladır ve bu tüketim modeli, Bos taurus'u diğer sığır ırklarından ayıran moleküler araştırmaların ortaya çıkmasına yol açmıştır. Sadece sığırlar değil, ekonomik değeri olan hayvanların farklı ırkları da piyasadaki ekonomik değerlerinde önemli farklılıklar gösterir; bu nedenle doğru genetik materyal tanımlaması zorunludur.

Önceki bir çalışmada, transpozon elementlerle ilişkili delesyon olayları sonucu oluşan Kore sığırlarına özgü yapısal varyasyonların (SV) tanımlanmasını doğrulamak için geleneksel PCR yöntemleri ve Sanger dizileme kullanılmıştır. Bu varyasyonlar, farklı sığır ırklarını (örneğin Kore sığırları ve Holstein sığırları) ayırt etmek için moleküler bir belirteç olarak kullanılabilir. Bununla birlikte, PCR'ın dezavantajları vardır ve her örnekte farklı nihai kopya miktarları bulunur. Geleneksel PCR'ın sınırlamalarının üstesinden gelmek ve önceki çalışmalarda tanımlanan Kore sığırlarına özgü SV bölgelerini doğru bir şekilde değerlendirmek için, Tanguo Üniversitesi Biyomedikal Bilimler Bölümü, Hayvancılık Araştırma Enstitüsü ve Tanguo Üniversitesi Tıp Fakültesi ile işbirliği içinde, naica® damlacık çip dijital PCR sistemini kullanarak Kore sığırlarında spesifik SV bölgelerinin daha doğru tespitini sağlamış ve sonuçlar, damlacık dijital PCR kullanılarak moleküler belirtecin nicel değerlendirmesi olarak Genomics&Informatics Dergisi'nde yayınlanmıştır.

Transpozisyon elementleri (TE'ler), sığır genomunun yaklaşık yarısını oluşturur. Genom evrimi sırasında yapısal varyasyon (SV) gerileme mutasyonları olmaksızın güçlü bir türe özgü belirteç olabilirler. Bu nedenle, yazar, Kore sığırlarının spesifik SV'sini doğru bir şekilde ölçmek için naica ️ ® Damlacık Çip Dijital PCR sistemini kullanmıştır. Kore sığır popülasyonundaki örneklerin alel frekans varyasyonu nispeten düşük olmasına rağmen, naica ️ ® Damlacık Çip Dijital PCR sistemi, mutlak kantifikasyon yoluyla son derece hassas tespit yapabilir ve PCR'den daha doğru kantifikasyon elde edebilir. Bu nedenle, naica ️ ® Damlacık Çip Dijital PCR sistemi platformu, geleneksel PCR'ye kıyasla moleküler belirteçlerin kantitatif değerlendirmesi için daha uygundur.

Öne çıkanlar:

▶ Naica® damlacık çipli dijital PCR sistemi, Kore sığırlarının spesifik SV değerini doğru bir şekilde ölçer.

▶ dPCR testi, tek molekülleri doğru bir şekilde ölçebilir ve belirli popülasyonların küçük kopyalarını analiz edebilir ve qPCR'ye kıyasla daha yüksek doğruluk oranına sahiptir.

▶ Sanger dizilemesinden sonra, damlacık çipli dijital PCR naica® sistemi, dizilemeye göre daha doğru tespit yapar ve daha düşük işletme maliyetine ve gereksinimine sahiptir.

▶ naica️® damlacık çipli dijital PCR sistemi, moleküler belirteçlerin kantitatif değerlendirilmesi için uygundur.