naica®ドロップレットチップデジタルPCRシステムは、韓国産牛肉の分子マーカーを正確に評価し、遺伝資源の識別を支援します。

韓国牛（Bos taurus coreanae）は、韓国の消費市場において食料資源として利用されている家畜です。その牛肉消費量は他の品種をはるかに上回っており、この消費パターンを受けて、韓国牛を他の牛の品種と区別するための分子生物学的研究が盛んに行われるようになりました。牛だけでなく、経済動物の品種によって市場における経済的価値に大きな差があるため、正確な遺伝資源の識別は不可欠です。

以前の研究では、従来のPCR法とサンガーシーケンス法を用いて、TE関連欠失イベントによって生成された韓国牛特有のSVの同定を検証しました。これは、異なる牛の品種（つまり、韓国牛とホルスタイン牛）を区別するための分子マーカーとして使用できます。しかし、PCRには欠点があり、各サンプルで最終的なコピー定量が異なります。従来のPCRの限界を克服し、以前の研究で同定された韓国牛特有のSV部位を正確に評価するために、唐国大学生物医学科は、畜産研究所および唐国大学医学部と共同で、naica®ドロップレットチップデジタルPCRシステムを使用して、韓国牛の特定のSV部位をより正確に検出することに成功し、その結果は、ドロップレットデジタルPCRを使用した分子マーカーの定量的評価として、Journal of Genomics&Informaticsに掲載されました。

転移因子（TE）はウシゲノムの約半分を占めています。これらは、ゲノム進化中の構造変異（SV）回帰変異を伴わずに、強力な種特異的マーカーとなり得ます。そのため、著者はnaica️®ドロップレットチップデジタルPCRシステムを用いて、韓国牛の特異的SVを正確に定量化しました。韓国牛集団におけるサンプルの対立遺伝子頻度変動は比較的低いものの、naica️®ドロップレットチップデジタルPCRシステムは絶対定量化により高感度検出が可能であり、PCRよりも正確な定量化を実現しています。したがって、naica️®ドロップレットチップデジタルPCRシステムプラットフォームは、従来のPCRと比較して、分子マーカーの定量的評価により適しています。

ハイライト：

▶ naica®ドロップレットチップデジタルPCRシステムを使用することで、韓国牛の特定のSVを正確に定量できます。

▶ dPCRアッセイは、単一分子を正確に定量し、特定の集団の微量コピーを分析することができ、qPCRと比較して精度が高い。

▶ サンガーシーケンス後、ドロップレットチップデジタルPCR naica®システムは、シーケンスよりも正確に検出でき、操作とコストが低くなります。

▶ naica️® ドロップレットチップデジタルPCRシステムは、分子マーカーの定量的評価に適しています。