नाइका® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली जर्मप्लाज्म की पहचान में सहायता के लिए कोरियाई गोमांस के आणविक मार्करों का सटीक मूल्यांकन करती है।

बोस टॉरस कोरिएने एक पालतू स्तनधारी है जो कोरियाई उपभोक्ता बाजार में खाद्य संसाधन के रूप में काम करता है। इसके मांस की खपत अन्य नस्लों की तुलना में कहीं अधिक है, और इस खपत पैटर्न के कारण आणविक अनुसंधान का उदय हुआ है जो बोस टॉरस को अन्य मवेशी नस्लों से अलग करता है। न केवल मवेशी, बल्कि आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण विभिन्न नस्लों के पशुओं के बाजार में आर्थिक मूल्य में भी काफी अंतर होता है, इसलिए सटीक जर्मप्लाज्म पहचान अत्यंत आवश्यक है।

पिछले एक अध्ययन में, टीई से संबंधित विलोपन घटनाओं द्वारा उत्पन्न कोरियाई मवेशियों के विशिष्ट एसवी की पहचान को मान्य करने के लिए पारंपरिक पीसीआर विधियों और सैंगर अनुक्रमण का उपयोग किया गया था। इसका उपयोग विभिन्न मवेशी नस्लों (यानी कोरियाई मवेशी और होल्स्टीन मवेशी) के बीच अंतर करने के लिए एक आणविक मार्कर के रूप में किया जा सकता है। हालांकि, पीसीआर में कुछ कमियां हैं और प्रत्येक नमूने में अंतिम प्रति मात्रा भिन्न होती है। पारंपरिक पीसीआर की सीमाओं को दूर करने और पिछले अध्ययनों में पहचाने गए कोरियाई मवेशियों के विशिष्ट एसवी स्थलों का सटीक मूल्यांकन करने के लिए, तांगुओ विश्वविद्यालय के जैव चिकित्सा विज्ञान विभाग ने पशुधन अनुसंधान संस्थान और तांगुओ विश्वविद्यालय चिकित्सा विद्यालय के सहयोग से नाइका® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली का उपयोग किया है। इससे कोरियाई मवेशियों में विशिष्ट एसवी स्थलों का अधिक सटीक पता लगाने में सफलता मिली है, और इसके परिणाम ड्रॉपलेट डिजिटल पीसीआर का उपयोग करके आणविक मार्कर के मात्रात्मक मूल्यांकन के रूप में जर्नल ऑफ जीनोमिक्स एंड इन्फॉर्मेटिक्स में प्रकाशित किए गए हैं।

ट्रांसपोज़िशन एलिमेंट्स (टीई) बोवाइन जीनोम का लगभग आधा हिस्सा बनाते हैं। जीनोम विकास के दौरान संरचनात्मक भिन्नता (एसवी) प्रतिगमन उत्परिवर्तन के बिना, ये एक शक्तिशाली प्रजाति-विशिष्ट मार्कर हो सकते हैं। इसलिए, लेखक ने कोरियाई मवेशियों के विशिष्ट एसवी की सटीक मात्रा निर्धारित करने के लिए नाइका ® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली का उपयोग किया है। हालांकि कोरियाई मवेशी आबादी में नमूने की एलील आवृत्ति भिन्नता अपेक्षाकृत कम है, नाइका ® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली पूर्ण मात्रा निर्धारण के माध्यम से अत्यधिक संवेदनशील पहचान कर सकती है, जिससे पीसीआर की तुलना में अधिक सटीक मात्रा निर्धारण प्राप्त होता है। अतः नाइका ® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली प्लेटफॉर्म पारंपरिक पीसीआर की तुलना में आणविक मार्करों के मात्रात्मक मूल्यांकन के लिए अधिक उपयुक्त है।

मुख्य बातें:

▶ नाइका® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली का उपयोग करके कोरियाई मवेशियों के विशिष्ट एसवी का सटीक रूप से निर्धारण किया जाता है।

▶ dPCR परख एकल अणुओं की सटीक मात्रा निर्धारित कर सकती है और विशिष्ट आबादी की छोटी प्रतियों का विश्लेषण कर सकती है, और qPCR की तुलना में इसकी सटीकता अधिक होती है।

▶ सैंगर सीक्वेंसिंग के बाद, ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर नाइका® सिस्टम सीक्वेंसिंग की तुलना में अधिक सटीक रूप से पता लगाता है और इसका संचालन और लागत कम होती है।

▶ नाइका® ड्रॉपलेट चिप डिजिटल पीसीआर प्रणाली आणविक मार्करों के मात्रात्मक मूल्यांकन के लिए उपयुक्त है।