El sistema de PCR digital con chip de gotas naica® evalúa con precisión los marcadores moleculares de la carne de vacuno coreana para facilitar la identificación del germoplasma.

Bos taurus coreanae es un mamífero domesticado que constituye un recurso alimenticio en el mercado coreano. Su consumo de carne supera con creces el de otras razas, lo que ha impulsado la investigación molecular para diferenciar a Bos taurus de otras razas bovinas. No solo el ganado vacuno, sino también las distintas razas de animales de interés económico presentan diferencias significativas en su valor comercial, por lo que la identificación precisa del germoplasma resulta fundamental.

En un estudio previo, se utilizaron métodos tradicionales de PCR y secuenciación Sanger para validar la identificación de variantes estructurales (SV) específicas del ganado coreano generadas por eventos de deleción asociados a elementos transponibles (TE). Estas variantes pueden utilizarse como marcadores moleculares para distinguir entre diferentes razas de ganado (por ejemplo, ganado coreano y ganado Holstein). Sin embargo, la PCR presenta limitaciones y cada muestra tiene diferentes cuantificaciones de copias finales. Para superar estas limitaciones y evaluar con precisión los sitios de SV específicos del ganado coreano identificados en estudios previos, el Departamento de Ciencias Biomédicas de la Universidad de Tanguo, en colaboración con el Instituto de Investigación Ganadera y la Facultad de Medicina de la Universidad de Tanguo, utilizó el sistema de PCR digital de microgotas naica®. Este sistema logró una detección más precisa de sitios de SV específicos en el ganado coreano, y los resultados se publicaron en la revista Journal of Genomics & Informatics como una evaluación cuantitativa del marcador molecular mediante PCR digital de microgotas.

Los elementos de transposición (ET) representan aproximadamente la mitad del genoma bovino. Pueden ser un potente marcador específico de especie sin mutaciones de regresión de variación estructural (VE) durante la evolución del genoma. Por lo tanto, el autor aplica el sistema de PCR digital de chip de gotas naica ️ ® cuantifica con precisión la VE específica del ganado coreano. Aunque la variación de la frecuencia alélica de la muestra en la población de ganado coreano es relativamente baja, el sistema de PCR digital de chip de gotas naica ️ ® puede realizar una detección altamente sensible a través de la cuantificación absoluta, logrando una cuantificación más precisa que la PCR. Por lo tanto, la plataforma del sistema de PCR digital de chip de gotas naica ️ ® es más adecuada para la evaluación cuantitativa de marcadores moleculares en comparación con la PCR tradicional.

Reflejos:

▶ El uso del sistema de PCR digital con chip de gotas naica® cuantifica con precisión el SV específico del ganado coreano.

▶ El ensayo dPCR puede cuantificar con precisión moléculas individuales y analizar pequeñas copias de poblaciones específicas, y tiene una mayor precisión en comparación con la qPCR.

▶ Tras la secuenciación de Sanger, el sistema de PCR digital con chip de gotas naica® detecta con precisión y tiene un coste y un funcionamiento más sencillos que la secuenciación.

▶ El sistema de PCR digital con chip de gotas naica️® es adecuado para la evaluación cuantitativa de marcadores moleculares.